MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004842	CCGG	2	8	448889	448896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_004842	GCT	2	6	448905	448910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_004842	GC	3	6	449495	449500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_004842	CTC	2	6	449584	449589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_004842	GAT	2	6	449668	449673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_004842	AG	3	6	449817	449822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004842	TGA	2	6	449838	449843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_004842	GCG	2	6	449844	449849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_004842	A	6	6	450226	450231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_004842	CAG	2	6	450237	450242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_004842	AAT	2	6	452828	452833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_004842	AC	3	6	452886	452891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_004842	GCC	2	6	453128	453133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_004842	AGC	2	6	453205	453210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_004842	A	9	9	453950	453958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_004842	ACT	2	6	453986	453991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_004842	A	7	7	453994	454000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_004842	CGA	2	6	454075	454080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_004842	GCG	2	6	454510	454515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_004842	AAT	3	9	454573	454581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004842	CG	4	8	454635	454642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_004842	CTG	2	6	454645	454650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_004842	CTT	2	6	454664	454669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_004842	TTTAT	2	10	456145	456154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_004842	CCGT	2	8	458651	458658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_004842	ATT	2	6	458709	458714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_004842	GAA	2	6	458758	458763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004842	CAGC	2	8	459371	459378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_004842	CAAA	2	8	459379	459386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_004842	CTGC	2	8	459390	459397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_004842	AGC	2	6	459400	459405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_004842	AC	3	6	459463	459468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_004842	GTT	2	6	459481	459486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_004842	GCA	2	6	459560	459565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_004842	ATC	2	6	459607	459612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_004842	GTCT	2	8	459685	459692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_004842	TGC	2	6	459836	459841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_004842	AC	3	6	459931	459936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_004842	CAGC	2	8	459944	459951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_004842	ATA	2	6	459995	460000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004842	CAA	2	6	460022	460027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_004842	CGC	2	6	460042	460047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_004842	GATA	2	8	460131	460138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_004842	ACT	2	6	460170	460175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_004842	AAG	2	6	460221	460226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_004842	CAA	2	6	460310	460315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_004842	CTC	2	6	460321	460326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_004842	TCA	2	6	460379	460384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_004842	GCT	2	6	462119	462124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_004842	GCA	2	6	462151	462156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_004842	CACG	2	8	462202	462209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_004842	CATG	2	8	462270	462277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_004842	CAA	2	6	463375	463380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_004842	GC	3	6	463440	463445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_004842	TCC	2	6	463458	463463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_004842	TGC	2	6	463494	463499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_004842	TGC	2	6	464199	464204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_004842	CCGG	2	8	464214	464221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_004842	TC	3	6	464248	464253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_004842	AAC	2	6	465930	465935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_004842	TAC	2	6	465948	465953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_004842	CAA	2	6	465968	465973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_004842	AAC	2	6	466002	466007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_004842	GCA	2	6	466135	466140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_004842	CA	3	6	466139	466144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_004842	TGC	2	6	466150	466155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_004842	AAT	2	6	466156	466161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_004842	GTT	2	6	466902	466907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_004842	GAT	2	6	466917	466922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_004842	AGC	2	6	467584	467589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_004842	CTT	2	6	467609	467614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_004842	GCA	2	6	467633	467638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_004842	AC	3	6	467705	467710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_004842	CCA	2	6	467757	467762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_004842	AAC	2	6	467770	467775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_004842	TCCC	2	8	467785	467792	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1577	NC_004842	GGCT	2	8	469846	469853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_004842	TG	3	6	473257	473262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_004842	GTT	2	6	473275	473280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_004842	TGT	2	6	473313	473318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_004842	CAA	2	6	473350	473355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_004842	TG	3	6	473367	473372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_004842	GGC	2	6	474267	474272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_004842	AC	4	8	474273	474280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_004842	GA	3	6	474300	474305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_004842	AC	3	6	474306	474311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_004842	TA	3	6	474326	474331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_004842	GGT	2	6	474338	474343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_004842	CACC	2	8	475494	475501	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1590	NC_004842	CA	3	6	475525	475530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_004842	CA	3	6	475543	475548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_004842	AC	3	6	475552	475557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_004842	TA	3	6	475561	475566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_004842	T	6	6	475603	475608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_004842	T	6	6	475631	475636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_004842	GCT	2	6	475656	475661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_004842	GAG	2	6	476640	476645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_004842	TGT	3	9	476942	476950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_004842	TTG	2	6	476985	476990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_004842	GGT	2	6	480230	480235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_004842	ATT	2	6	480265	480270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_004842	GA	3	6	480283	480288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004842	GGC	2	6	482301	482306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_004842	GC	3	6	482312	482317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_004842	TG	3	6	482341	482346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_004842	CAC	2	6	482356	482361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_004842	TTG	2	6	482402	482407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_004842	GCG	2	6	482441	482446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_004842	GT	3	6	482470	482475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_004842	CAG	2	6	482491	482496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_004842	TTA	2	6	482497	482502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004842	TG	3	6	482526	482531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004842	TGTGC	2	10	482677	482686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_004842	ATGC	2	8	482790	482797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_004842	CGG	2	6	482808	482813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_004842	ATC	2	6	482862	482867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_004842	CCCG	2	8	482971	482978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1618	NC_004842	GCC	2	6	483015	483020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_004842	ACG	2	6	483108	483113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_004842	AGT	2	6	483536	483541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_004842	CAACG	2	10	483622	483631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1622	NC_004842	GTA	2	6	483652	483657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_004842	GCC	2	6	483768	483773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_004842	TG	3	6	483793	483798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_004842	TCGT	2	8	483823	483830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_004842	TTTG	2	8	483880	483887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_004842	GGC	2	6	485812	485817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_004842	GAG	2	6	485822	485827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_004842	TGC	2	6	485858	485863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_004842	CCG	2	6	485909	485914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_004842	GGT	2	6	485922	485927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_004842	GCG	2	6	485946	485951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_004842	GTC	2	6	485959	485964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_004842	AGC	2	6	485992	485997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_004842	GCG	2	6	485999	486004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_004842	TTG	2	6	486011	486016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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